預(yù)測哪些藥物可以有效治療不同的腸癌患者

2018-07-24 來源：腫瘤免疫細胞治療資訊標(biāo)簽：掌上醫(yī)生喝茶減肥一天瘦一斤安全減肥 cps聯(lián)盟美容護膚

摘要：在研究中，該小組在50個腸癌細胞系中測試了265種現(xiàn)有的抗癌藥物。以前已經(jīng)將基因組和轉(zhuǎn)錄組的細節(jié)用于預(yù)測哪些藥物在特定癌癥病例中起作用，但是某些藥物的活性無法預(yù)測。

科學(xué)家們首次完成了對腸癌細胞中許多蛋白質(zhì)的詳細研究。來自WellcomeTrustSangerInstitute的科學(xué)家調(diào)查了蛋白質(zhì)在預(yù)測常見突變?nèi)绾斡绊懓┘毎械鞍踪|(zhì)的作用以及這些蛋白質(zhì)在預(yù)測癌癥對治療反應(yīng)方面的重要作用。

結(jié)果，今天（8月29日）在“細胞報告”中發(fā)表，使科學(xué)家們更好地了解腸癌后的細胞過程，并且可以使研究人員能夠預(yù)測哪些藥物可以有效治療不同的腸癌患者。

每天有110人被診斷患有腸癌。每年有大約4100例新病例，是英國第四大癌癥。

為了了解癌癥的生物學(xué)基礎(chǔ)，科學(xué)家傳統(tǒng)上研究了所有的癌癥基因-癌癥中的基因組和所有RNA-轉(zhuǎn)錄組。然而，研究中的盲點一直是研究所有的蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)組-它是蛋白質(zhì)，它們是細胞機械的基礎(chǔ)。

在新研究中，科學(xué)家對腸癌中的蛋白質(zhì)進行了深入細致的研究，以研究蛋白質(zhì)在預(yù)測不同藥物對癌癥的作用方面發(fā)揮的作用。研究人員分析了50種腸癌細胞系中的9,000種蛋白質(zhì)。

來自WellcomeTrustSanger研究所和倫敦癌癥研究所的主要作者JyotiChoudhary博士說：“這項研究是結(jié)腸直腸癌細胞系的第一次詳細表征，重要的是將蛋白質(zhì)組學(xué)納入癌癥研究中，因為蛋白質(zhì)是已知蛋白質(zhì)組合和功能的獨特信息，過去的基因組和轉(zhuǎn)錄組研究已被證明是癌癥研究中的一個盲點-但現(xiàn)在包括蛋白質(zhì)組，我們有全貌。”

該團隊能夠構(gòu)建促進腸癌的蛋白質(zhì)協(xié)調(diào)網(wǎng)絡(luò)。研究人員使用CRISPR-Cas9來破壞或敲除編碼關(guān)鍵蛋白質(zhì)的單一基因，并觀察其網(wǎng)絡(luò)中蛋白質(zhì)的影響。

威康信托桑格研究所的第一作者TheodorosRoumeliotis博士說：“我們發(fā)現(xiàn)，沉默一個基因會對網(wǎng)絡(luò)的其余部分產(chǎn)生影響，減少了其他蛋白質(zhì)的數(shù)量，就像一個漣漪效應(yīng)一樣，我們已經(jīng)確定了蛋白質(zhì)網(wǎng)絡(luò)可以用于腸癌藥物，我們只能通過研究蛋白質(zhì)組來發(fā)現(xiàn)。”

在研究中，該小組在50個腸癌細胞系中測試了265種現(xiàn)有的抗癌藥物。以前已經(jīng)將基因組和轉(zhuǎn)錄組的細節(jié)用于預(yù)測哪些藥物在特定癌癥病例中起作用，但是某些藥物的活性無法預(yù)測。

通過研究蛋白質(zhì)組，該團隊可以預(yù)測未被基因組學(xué)或轉(zhuǎn)錄組學(xué)解釋的藥物反應(yīng)。

WellcomeTrustSanger研究所的資深作者UltanMcDermott博士說：“這項研究對腸癌患者有希望，它證實這種常見的癌癥實際上由五種不同的亞型組成，可能需要不同的藥物治療，令人驚訝的是，蛋白質(zhì)可能比我們以前認為的更容易預(yù)測藥物敏感性，未來我們可能需要測試患者的基因組，轉(zhuǎn)錄組和蛋白質(zhì)組，以充分預(yù)測其對癌癥藥物的反應(yīng)，并更有效地分層患者進行臨床試驗。一切都適合個性化醫(yī)學(xué)。”

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