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2000個遺傳突變解釋癌細(xì)胞遺傳復(fù)雜性

摘要:最令人驚訝的是,一些重要的突變只發(fā)生在腫瘤的某些區(qū)域內(nèi),這說明了癌細(xì)胞的復(fù)雜性。而且研究人員還證明了利用單一活檢的方法(目前臨床上的標(biāo)準(zhǔn)方法),無法精確的解釋癌細(xì)胞的遺傳組成。

美國Cedars-Sinai醫(yī)院的研究人員在食道癌組織樣品中發(fā)現(xiàn)了超過2000個遺傳突變,從中詳細(xì)解釋了癌癥復(fù)雜性,這些發(fā)現(xiàn)表明即使是單個腫瘤的不同區(qū)域,也具有不同的遺傳模式。

這一研究成果公布在NatureGenetics雜志上,將有助于解釋通過靶向一個特異性遺傳缺陷,為何很難戰(zhàn)勝癌癥,以及外科醫(yī)師們對患者腫瘤進(jìn)行單一活檢,為何只能了解這個腫瘤的一部分遺傳突變。而且隨著時間的推移,癌細(xì)胞也在不斷的變化其組成。

文章的作者之一,Cedars-Sinai醫(yī)院血液學(xué)和腫瘤學(xué)助理教授林德成(DechenLin,音譯)博士說,“腫瘤并不是單一疾病。在同一位患者體內(nèi)和不同時間里會出現(xiàn)多種疾病,腫瘤中有數(shù)以百萬的細(xì)胞,其組成部分差別很大。”

這一研究組分析的是食管鱗狀細(xì)胞癌(esophagealsquamouscellcarcinoma,ESCC),這種疾病是最具侵襲性的癌癥類型之一,其早期臨床診斷及治療方法有限,患者的5年生存率僅為20%(美國癌癥協(xié)會數(shù)據(jù))。

為了構(gòu)建ESCC的突變列表,研究人員采用了高能計(jì)算機(jī)系統(tǒng),分析13位患者的51個腫瘤樣品遺傳數(shù)據(jù),從中利用復(fù)雜的運(yùn)算方法解析了基因突變和表觀遺傳過程。結(jié)果研究人員發(fā)現(xiàn)在樣品中發(fā)現(xiàn)了2,178個遺傳突變,其中數(shù)十個突變都是發(fā)生在已知與癌癥發(fā)展相關(guān)聯(lián)的基因上。

最令人驚訝的是,一些重要的突變只發(fā)生在腫瘤的某些區(qū)域內(nèi),這說明了癌細(xì)胞的復(fù)雜性。而且研究人員還證明了利用單一活檢的方法(目前臨床上的標(biāo)準(zhǔn)方法),無法精確的解釋癌細(xì)胞的遺傳組成。

除了這些遺傳突變,這項(xiàng)研究也重建了腫瘤的“傳記”,記錄了疾病生命周期中何時第一次出現(xiàn)這些突變。

“這項(xiàng)研究試圖尋找同一位患者,或者不同患者間的腫瘤異質(zhì)性。這也是第一次在單一腫瘤中以全局化的角度分析不同區(qū)域的表觀遺傳學(xué)變化,”文章的通訊作者BenjaminBerman博士說。為了能系統(tǒng)性研究這些不同區(qū)域,Berman實(shí)驗(yàn)室的HuyDinh等人研發(fā)了新的計(jì)算方法。

下一步研究人員將會將這些分析技術(shù)應(yīng)用于其它癌癥,分析他們迄今為止發(fā)現(xiàn)的遺傳和表觀遺傳變化的意義。從而可以以此為基礎(chǔ),研發(fā)更有效的,個性化的癌癥治療方法。研究表明腫瘤的異質(zhì)性是導(dǎo)致出現(xiàn)癌癥藥物耐藥性,和治療失敗的主要原因之一,破解腫瘤的基因組多樣性和演變過程,將有助于發(fā)現(xiàn)更多靶標(biāo),以及新的個性化醫(yī)學(xué)戰(zhàn)略。

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