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Cancer Discovery:細(xì)胞對(duì)CRISPR的應(yīng)答不容忽視

2016-06-09 來(lái)源:健客網(wǎng)社區(qū)  標(biāo)簽: 掌上醫(yī)生 喝茶減肥 一天瘦一斤 安全減肥 cps聯(lián)盟 美容護(hù)膚
摘要:細(xì)菌一直在與病毒或入侵核酸進(jìn)行斗爭(zhēng),為此它們演化出了多種防御機(jī)制,CRISPR-Cas適應(yīng)性免疫系統(tǒng)就是其中之一。規(guī)律成簇的間隔短回文重復(fù)CRISPR與內(nèi)切酶Cas9的組合,可以在引導(dǎo)RNA的指引下,靶標(biāo)并切割入侵者的遺傳物質(zhì)。

  這兩年幾乎人人都在談?wù)揅RISPR基因組編輯,那么細(xì)胞對(duì)這個(gè)系統(tǒng)的闖入作何感想呢?最近發(fā)表的一項(xiàng)研究指出,細(xì)胞會(huì)對(duì)CRISPR-Cas9產(chǎn)生一種不容忽視的應(yīng)答。

  細(xì)菌一直在與病毒或入侵核酸進(jìn)行斗爭(zhēng),為此它們演化出了多種防御機(jī)制,CRISPR-Cas適應(yīng)性免疫系統(tǒng)就是其中之一。規(guī)律成簇的間隔短回文重復(fù)CRISPR與內(nèi)切酶Cas9的組合,可以在引導(dǎo)RNA的指引下,靶標(biāo)并切割入侵者的遺傳物質(zhì)。這種特性使CRISPR系統(tǒng)成為了基因組編輯和基因功能研究的實(shí)用工具。

  CRISPR-Cas9能夠很方便的在哺乳動(dòng)物細(xì)胞中進(jìn)行體細(xì)胞遺傳篩選。但哈佛大學(xué)Dana-Farber癌癥研究所的科學(xué)家們?cè)趯?shí)踐中發(fā)現(xiàn),CRISPR-Cas9靶標(biāo)會(huì)使細(xì)胞產(chǎn)生一種不依賴基因的應(yīng)答。而這種應(yīng)答會(huì)干擾人們對(duì)CRISPR篩選數(shù)據(jù)的解讀。

  為了鑒定增殖的必需基因,研究人員用CRISPR-Cas9在33個(gè)癌細(xì)胞系中進(jìn)行了全基因組的功能缺失篩選。他們發(fā)現(xiàn),基因組編輯之后的基因拷貝數(shù)增加和細(xì)胞活力下降有很強(qiáng)的關(guān)聯(lián)。

  在拷貝數(shù)增加的區(qū)域中,CRISPR-Cas9靶標(biāo)會(huì)誘導(dǎo)G2細(xì)胞周期停滯,由此顯著減少癌細(xì)胞的增殖。這項(xiàng)研究表明,被CRISPR-Cas9靶標(biāo)的基因組引起了不依賴基因的抗增殖細(xì)胞應(yīng)答。理解這種影響對(duì)于正確解讀CRISPR-Cas9篩選數(shù)據(jù)非常重要。

  基因篩選是經(jīng)典的生物學(xué)研究方法,常用于鑒定在生物學(xué)過(guò)程中起作用的基因。十多年來(lái)RNAi一直是這一領(lǐng)域的王者,然而新興技術(shù)的涌現(xiàn)(尤其是CRISPR技術(shù))正在逐漸瓦解RNAi的統(tǒng)治地位。那么,在RNAi和CRISPR篩選之間我們究竟應(yīng)該如何抉擇呢?

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