基因組學(xué)主要包括功能基因組學(xué)和結(jié)構(gòu)基因組學(xué)。轉(zhuǎn)錄組學(xué)則是功能基因組學(xué)中的重要部分,是指在整體水平研究某一個(gè)細(xì)胞中基因的全部轉(zhuǎn)錄本在種類、結(jié)構(gòu)、功能、和轉(zhuǎn)錄調(diào)控方面規(guī)律的科學(xué)。近年來(lái)已有越來(lái)越多的研究在轉(zhuǎn)錄組水平上探索其病理生理機(jī)制,用于轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究的方法主要是基因芯片技術(shù)、第二代測(cè)序技術(shù)。銀屑病是一種多基因遺傳相關(guān)的炎癥性皮膚病,銀屑病轉(zhuǎn)錄組學(xué)的研究也隨著轉(zhuǎn)錄組學(xué)的研究方法發(fā)展而不斷進(jìn)步。
一、基因芯片技術(shù)
基因芯片技術(shù)因其高效、簡(jiǎn)易等優(yōu)勢(shì)而被廣泛應(yīng)用,應(yīng)用的是核苷酸原位雜交技術(shù),將核苷酸通過(guò)各種技術(shù)手段按順序排列、固定于固體載體上,形成DNA分子點(diǎn)陣,與處理好的樣品進(jìn)行雜交,從而獲得所測(cè)樣品的基因數(shù)量和序列信息。
有研究采用基因芯片技術(shù)比較正常皮膚與銀屑病患者皮損、非皮損組織的miRNA表達(dá)。結(jié)果發(fā)現(xiàn),14個(gè)差異表達(dá)的miRNA,正常皮膚與銀屑病非皮損組織比較,存在表達(dá)差異的有11個(gè);正常皮膚與銀屑病皮損組織比較,存在表達(dá)差異的有12個(gè)。研究發(fā)現(xiàn),銀屑病皮損表皮中miR-21表達(dá)量較正常皮膚高出2.8倍,銀屑病皮損真皮中其表達(dá)量較正常皮膚高出2.6倍,并通過(guò)抑制miR-21表達(dá)導(dǎo)致活化T細(xì)胞凋亡的比率增加,從而得出miR-21可以抑制活化T細(xì)胞的凋亡,其過(guò)度表達(dá)可能是導(dǎo)致T細(xì)胞介導(dǎo)銀屑病的發(fā)生。
有作者通過(guò)定量RT-PCR得到miR-31主要在角質(zhì)形成細(xì)胞、成纖維細(xì)胞、黑素細(xì)胞中表達(dá),他們運(yùn)用基因芯片對(duì)正常皮膚、銀屑病皮損和非皮損的miR-31表達(dá)進(jìn)行比較。正常皮膚中miR-31低表達(dá),且僅限于基底層細(xì)胞,相反,在銀屑病非皮損中較高表達(dá),且在基底層和基底層以上細(xì)胞均出現(xiàn),銀屑病皮損中表達(dá)更高,且主要出現(xiàn)在基底層以上細(xì)胞。
二、第二代測(cè)序技術(shù)
與基因芯片技術(shù)相比,轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)(RNA-seq)可以檢測(cè)發(fā)現(xiàn)新序列,無(wú)需設(shè)計(jì)已知探針;靈敏度高,可以檢測(cè)低豐度目標(biāo)序列,并可以檢測(cè)重復(fù)序列,數(shù)字化信號(hào)使其用于較高的精確度,更廣泛的動(dòng)態(tài)變化范圍,能夠同時(shí)檢測(cè)、定量正常和稀有轉(zhuǎn)錄本。
有研究通過(guò)RNA-seq技術(shù)比較了銀屑病、扁平苔蘚、特應(yīng)性皮炎患者與健康人外周血T細(xì)胞的基因表達(dá)差異。在銀屑病組中發(fā)現(xiàn)上調(diào)表達(dá)基因131個(gè),下調(diào)20個(gè),經(jīng)過(guò)RT-PCR驗(yàn)證,在銀屑病組中CD244和KLRC2下調(diào)表達(dá),RPRD1B上調(diào)表達(dá),與RNA-seq結(jié)果一致。雖然基因芯片技術(shù)是重要的技術(shù)手段,但只能發(fā)現(xiàn)部分差異表達(dá)基因,而RNA-seq能補(bǔ)充這些技術(shù)。
三、兩種技術(shù)比較
在兩種技術(shù)的研究中,發(fā)現(xiàn)了很多共同的差異表達(dá)基因。其中miR-21有較高的差異倍數(shù)。研究發(fā)現(xiàn),miR-21負(fù)調(diào)控轉(zhuǎn)錄激活p63,在健康對(duì)照與未經(jīng)治療的銀屑病患者樣本分析中得到miR-21與轉(zhuǎn)錄激活p63呈正相關(guān),與轉(zhuǎn)錄激活p63mRNA呈負(fù)相關(guān),而轉(zhuǎn)錄激活p63是皮膚穩(wěn)定的重要因子,與角質(zhì)形成細(xì)胞的分化增殖密切相關(guān),其可以直接結(jié)合且反式激活Dicer啟動(dòng)子,從而調(diào)控Dicer的轉(zhuǎn)錄,促進(jìn)表皮的分化分層。
基因芯片技術(shù)相比,RNA-seq是一種更精確的轉(zhuǎn)錄組分析方法,其應(yīng)用具有革命性意義。但是RNA-seq也具有其特殊的局限性:組織特異性,不同組織類型測(cè)得的序列是不統(tǒng)一的;時(shí)間獨(dú)立性,在生命周期的不同時(shí)間測(cè)得的序列有所不同。轉(zhuǎn)錄組研究方法仍有待優(yōu)化。
四、結(jié)語(yǔ)
雖然銀屑病的確切病因尚不清楚,但普遍被認(rèn)為是一種與基因、免疫、環(huán)境相關(guān)的復(fù)雜疾病。通過(guò)全基因組關(guān)聯(lián)研究得知,很多基因已經(jīng)被證實(shí)與銀屑病的病因相關(guān)。整合了基因、環(huán)境和免疫因素的模型已經(jīng)建成。近年來(lái),銀屑病的發(fā)病機(jī)制和治療方面進(jìn)展較快。隨著轉(zhuǎn)錄組研究方法的不斷進(jìn)步,轉(zhuǎn)錄組水平上的研究也越來(lái)越多,不斷發(fā)現(xiàn)新的轉(zhuǎn)錄本、差異表達(dá)基因,更好地了解銀屑病的發(fā)病機(jī)制、遺傳背景,為銀屑病的治療提供新的靶點(diǎn)。
1.吡硫翁鋅氣霧劑:適用于銀屑病,脂溢性皮炎,皮脂溢出及其它鱗屑性皮膚病。 2.克銀丸:清熱解毒,祛風(fēng)止癢。用于皮損基底紅,舌基底紅,便秘,尿黃屬血熱風(fēng)燥型的銀屑病。 3.阿維A膠囊:(1)嚴(yán)重的銀屑病,其中包括紅皮病型銀屑病、膿皰型銀屑病等。(2)其它角化性皮膚病。
健客價(jià): ¥709銀屑膠囊(金揚(yáng)沙):祛風(fēng)解毒,用于銀屑病。 復(fù)方丙酸氯倍他索軟膏(金紐爾):復(fù)方丙酸氯倍他索軟膏用于慢性濕疹銀屑病扁平苔蘚盤狀紅斑狼瘡神經(jīng)性皮炎掌跖膿皰病等皮質(zhì)類固醇外用治療有效的皮膚病。 復(fù)方氨肽素片:用于銀屑病(牛皮癬)。
健客價(jià): ¥645卡泊三醇軟膏(金迪銀):用于尋常型銀屑病的局部治療。 迪銀 復(fù)方氨肽素片:用于銀屑?。ㄅFぐ_)。
健客價(jià): ¥789卡泊三醇軟膏(金迪銀):用于尋常型銀屑病的局部治療。 鹵米松乳膏(孚松):對(duì)皮質(zhì)類固醇治療有效的非感染性炎癥性皮膚病。如脂溢性皮炎、接觸性皮炎、異位性皮炎、局限性神經(jīng)性皮炎、錢幣狀皮炎和尋常型銀屑病。
健客價(jià): ¥348祛風(fēng)解毒,用于銀屑病。
健客價(jià): ¥999卡泊三醇軟膏(金迪銀):用于尋常型銀屑病的局部治療。 復(fù)方青黛膠囊(天寧寺):清熱解毒,消斑化瘀,祛風(fēng)止癢。用于血熱挾淤,熱毒熾盛證;進(jìn)行期銀屑病,玫瑰糠疹、藥疹見上述證候者。
健客價(jià): ¥958阿維A膠囊: 1、嚴(yán)重的銀屑病,其中包括紅皮病型銀屑病、膿皰型銀屑病等。 2、其它角化性皮膚病。 消銀顆粒:清熱涼血,養(yǎng)血潤(rùn)燥,祛風(fēng)止癢。用于血熱風(fēng)燥型白疵和血虛風(fēng)燥型白疵。癥見皮疹為點(diǎn)滴狀,基底鮮紅色,表面覆有銀白色鱗屑,或皮疹表面覆有較厚的銀白色鱗屑,較干燥,基底淡紅色瘙癢較甚等。
健客價(jià): ¥762疏通氣血,軟堅(jiān)消積,清熱解毒,燥濕殺蟲。用于銀屑病(牛皮癬)。
健客價(jià): ¥23疏通氣血、軟堅(jiān)消積、清熱解毒、燥濕殺蟲。用于銀屑病(牛皮癬)。
健客價(jià): ¥9疏通氣血,軟堅(jiān)消積,清熱解毒,燥濕殺蟲,用于銀屑病(牛皮癬)。
健客價(jià): ¥31疏通氣血,軟堅(jiān)消積,清熱解毒,燥濕殺蟲。用于銀屑?。ㄅFぐ_)。
健客價(jià): ¥29疏通氣血,軟堅(jiān)消積,清熱解毒,燥濕殺蟲。用于銀屑病(牛皮癬)。
健客價(jià): ¥22