在最近一項研究中,科學家們首次通過模擬哺乳動物單個細胞基因組的物理結(jié)構(gòu),給我們展示了關(guān)于DNA在細胞中包裝的獨特視角。
通過這項新的技術(shù),科學家們能夠理解細胞中染色體的組合方式,以及決定細胞活化或者不活化的分子基礎(chǔ)。
目前該技術(shù)僅僅在小鼠的細胞上進行了試驗,不過它能夠清楚地幫助我們理解動物生長發(fā)育的機制以及細胞的功能紊亂是如何導致疾病的發(fā)生的。
“通過對基因以及控制元件的時空坐標進行全面地了解,能夠幫助我們理解基因表達的調(diào)控以及維持其活性的分子機制”,研究者們之一,來自英國劍橋大學的ErnestLaue說道。
基因組可以被認為是我們身體的藍圖,但藍圖的不同部分被使用的時機也大不相同。
人類細胞中儲存的DNA長達兩米,而其能夠被包裹于直徑僅為0.005微米的細胞核中。因此,DNA的包裹機制應該十分地精確。
在這項研究中,科學家們觀察了小鼠的胚胎干細胞中的DNA的折疊組裝的情況。通過一種叫做HI-C的方法,即通過對DNA進行定位從而計算得到基因組結(jié)構(gòu),科學家們得到了八個細胞基因組的高清圖像。
雖然研究者們僅僅捕捉到了整個基因組中DNA連接的1.2%-4.1%,但由于高清圖像的存在,他們能夠獲取基因組的3D結(jié)構(gòu),從而對每個基因是否處于活化狀態(tài)進行判斷。
“對基因組進行如此高分辨率的3D展示是此前從未出現(xiàn)過的”,英國分子生物學家TomCollins說道。他認為在未來的研究中應當囊括基因組之間相互作用的機制,以及DNA的結(jié)構(gòu)對其表達活性的影響。“如果我們將這一技術(shù)應用到基因簇存在缺陷的細胞,例如癌細胞中,那么我們有可能找到疾病發(fā)生的根本原因以及治療方法”。
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