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破解耐藥的“利刃”:基因組測(cè)序揭示轉(zhuǎn)移性乳腺癌基因改變

2016-12-11 來(lái)源:醫(yī)脈通腫瘤科  標(biāo)簽: 掌上醫(yī)生 喝茶減肥 一天瘦一斤 安全減肥 cps聯(lián)盟 美容護(hù)膚
摘要:隨著乳腺癌內(nèi)分泌治療藥物不斷取得進(jìn)步,伴隨而來(lái)的獲得性耐藥問(wèn)題也日益明顯。復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移性雌激素受體陽(yáng)性乳腺癌的基因組變化在不同的原發(fā)腫瘤中差異較大,是產(chǎn)生耐藥的重要原因。

  當(dāng)?shù)貢r(shí)間12月6日至12月10日,2016年底世界乳腺癌領(lǐng)域最重要的國(guó)際會(huì)議——圣安東尼奧乳腺癌會(huì)議在美國(guó)召開。12月7日全體大會(huì)上,研究者口頭報(bào)告了雌激素治療抵抗的轉(zhuǎn)移性乳腺癌全基因組測(cè)序和轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果。

  隨著乳腺癌內(nèi)分泌治療藥物不斷取得進(jìn)步,伴隨而來(lái)的獲得性耐藥問(wèn)題也日益明顯。復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移性雌激素受體陽(yáng)性乳腺癌的基因組變化在不同的原發(fā)腫瘤中差異較大,是產(chǎn)生耐藥的重要原因。耐藥后乳腺癌患者的可選治療策略并不多,因此,理解耐藥的分子機(jī)制對(duì)改善內(nèi)分泌治療至關(guān)重要。

  研究?jī)?nèi)容

  研究采用兩種二代測(cè)序(NGS)技術(shù):全外顯子測(cè)序(WES)用于檢測(cè)腫瘤和胚系突變,轉(zhuǎn)錄組測(cè)序(RAN-seq)用于分析腫瘤的RNA表達(dá)。突變檢測(cè)包括點(diǎn)突變、插入/缺失、異位、拷貝數(shù)變化、基因表達(dá)異常等。收集患者的臨床病例參數(shù),并將其與基因信息關(guān)聯(lián)。

  轉(zhuǎn)移灶腫瘤組織標(biāo)本來(lái)自88例對(duì)一種或一種以上激素治療耐藥的轉(zhuǎn)移性乳腺癌患者,其中有27例患者有治療前的初始標(biāo)本和治療后(他莫昔芬、芳香化酶抑制劑、氟維司群)的耐藥標(biāo)本。

  WES測(cè)序結(jié)果顯示,在未治療的雌激素受體陽(yáng)性乳腺癌標(biāo)本中,ESR1、ERBB2和RB1基因突變的發(fā)生率有較大差異,ESR1突變占19.3%(n=17),CCND1擴(kuò)增占59.1%(n=52),MAP2K4雙等位基因失活占15.9%(n=14)。

  與初始腫瘤標(biāo)本相比,來(lái)自同一個(gè)患者的獲得性耐藥后腫瘤標(biāo)本有一些新的基因突變出現(xiàn),包括ESR1、ERBB2、PIK3CA、PTEN、RB1、AKT1等。其中有一些如TP53、GATA3、PIK3CA、AKT1和KRAS與原發(fā)腫瘤關(guān)系更為密切。

  對(duì)轉(zhuǎn)移性標(biāo)本轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)的初步分析可以將個(gè)體化耐藥機(jī)制進(jìn)行分類,并納入到更大的耐藥模型中。研究者指出,部分基因突變可能涉及到乳腺癌治療抵抗:ESR1與芳香化酶抑制劑,ERBB2與雌激素受體靶向藥,RB1與內(nèi)分泌治療和CDK4/6抑制劑,相關(guān)領(lǐng)域的研究正在進(jìn)行中。

  深入分子層面

  上述研究結(jié)果顯示出轉(zhuǎn)移灶腫瘤組織分子檢測(cè)的重要性。腫瘤組織生長(zhǎng)是動(dòng)態(tài)進(jìn)化的,轉(zhuǎn)移灶雖然是從原發(fā)灶而來(lái),但內(nèi)部已經(jīng)發(fā)生了變化。針對(duì)復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移疾病的治療要考慮到這些復(fù)雜因素,并在臨床試驗(yàn)和新藥探索上朝這方面努力。

  基因測(cè)序給出的突變結(jié)果很多,但評(píng)價(jià)這些突變的重要性是一項(xiàng)挑戰(zhàn)。在檢測(cè)對(duì)象上,除了全基因組外,轉(zhuǎn)錄組分析也能提供有價(jià)值的信息。對(duì)乳腺癌耐藥來(lái)說(shuō),腫瘤進(jìn)化出耐藥可通過(guò)DNA突變以外的途徑,比如表觀遺傳學(xué),這就需要在轉(zhuǎn)錄層面進(jìn)行檢測(cè)。

  結(jié)語(yǔ)

  原發(fā)腫瘤的分子特點(diǎn)部分決定了轉(zhuǎn)移的潛能;而轉(zhuǎn)移腫瘤又因外部治療和內(nèi)部環(huán)境的變化,出現(xiàn)了獨(dú)有的分子特點(diǎn)。對(duì)于晚期乳腺癌而言,控制、監(jiān)測(cè)轉(zhuǎn)移病變和逆轉(zhuǎn)耐藥是延長(zhǎng)生存的主要方向。

  2016SABCS上公布這項(xiàng)乳腺癌基因檢測(cè)研究是更為龐大計(jì)劃“耐藥圖譜”的一部分,現(xiàn)在Dana-Farber精準(zhǔn)醫(yī)療癌癥中心已經(jīng)收集了超過(guò)250個(gè)標(biāo)本,同時(shí)還每2個(gè)月采集一次患者的血液樣本,未來(lái)晚期乳腺癌的時(shí)空變化有望得到更好的闡釋。

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