江蘇疾控部門發(fā)現(xiàn)新型環(huán)狀單鏈DNA病毒

2018-07-20 來源：中國病毒學(xué)論壇標(biāo)簽：掌上醫(yī)生喝茶減肥一天瘦一斤安全減肥 cps聯(lián)盟美容護(hù)膚

摘要：據(jù)介紹，該病毒基因組含2種主要開放讀碼框(ORFs)，分別編碼復(fù)制酶蛋白R(shí)ep和衣殼蛋白Cap；有2個(gè)基因間隔區(qū)，其中大的間隔區(qū)含有環(huán)狀病毒特征性莖環(huán)結(jié)構(gòu)。

16日，記者從江蘇省疾控中心獲悉，該中心從一例新加坡回國發(fā)熱病人送檢樣本中，首次鑒定出一種新型環(huán)狀單鏈DNA病毒。

根據(jù)該中心公布信息：此次新發(fā)現(xiàn)病毒是該中心病原所對今年9月27日江蘇出入境檢驗(yàn)檢疫局送檢的一例從新加坡回國的發(fā)熱病人咽拭子樣本進(jìn)行病原體檢測后所得。病原所實(shí)驗(yàn)室人員通過對送檢樣本用高通量測序技術(shù)檢測發(fā)現(xiàn)其中含有一種新型環(huán)狀單鏈DNA病毒片段，后根據(jù)高通量測序reads序列設(shè)計(jì)特異引物，對病人咽拭子樣本進(jìn)行PCR擴(kuò)增，產(chǎn)物經(jīng)過sanger測序、序列組裝，于10月26日獲得該病毒全長基因序列3018nt。

據(jù)介紹，該病毒基因組含2種主要開放讀碼框(ORFs)，分別編碼復(fù)制酶蛋白R(shí)ep和衣殼蛋白Cap；有2個(gè)基因間隔區(qū)，其中大的間隔區(qū)含有環(huán)狀病毒特征性莖環(huán)結(jié)構(gòu)。與該病毒最相似的為豬糞相關(guān)的環(huán)狀病毒5(porcinestool-associatedcircularvirus5(PoSCV5)，isolateCP3)，編碼蛋白氨基酸序列相似性約為43%和50%，進(jìn)化分析揭示這2種編碼蛋白分別與環(huán)狀病毒科及未分類的環(huán)狀單鏈DNA病毒聚為一類，疑似為一種新型病毒。

目前，該中心初步將該病毒命名為HumanPoSCV5-likecircularvirus(isolateMRJ)，基因組序列已遞交GenBank數(shù)據(jù)庫(Accessionno.KY052047)。

根據(jù)實(shí)驗(yàn)室分析，在對病人的尿、血和唾液樣本進(jìn)一步檢測中發(fā)現(xiàn)，唾液中可以檢測出該病毒，而尿和血液中檢測不到。

此前發(fā)現(xiàn)的豬糞相關(guān)的環(huán)狀病毒可引起豬腹瀉，人未見感染報(bào)道。其他種屬的環(huán)狀單鏈DNA病毒有在多發(fā)性硬化癥病人的腦積液和血清、心包炎病人的心包液及腦炎病人的腦積液檢測出的報(bào)道，但是與疾病的聯(lián)系均不能確立。所以，目前該新型環(huán)狀單鏈DNA病毒與病例所患疾病的關(guān)聯(lián)還不明確。

目前，實(shí)驗(yàn)室正對樣本進(jìn)行病毒分離培養(yǎng)，以便開展下一步的研究工作。

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