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超越雙螺旋!科學家首次證實人體細胞內(nèi)存在C-C配對的4鏈DNA結構,或與衰老、癌癥有關

2018-05-03 來源:奇點網(wǎng)  標簽: 掌上醫(yī)生 喝茶減肥 一天瘦一斤 安全減肥 cps聯(lián)盟 美容護膚
摘要:科學家對生理條件下人體的DNA結構又有了新的發(fā)現(xiàn)。之前認為不可能存在于人體內(nèi)的、違反常識的DNA二級結構,澳大利亞Garvan醫(yī)學研究所的研究人員在人體內(nèi)看到了。這項研究成果刊登在了近期的《自然化學》上。

我們對人體的認知一直不停地被刷新。

如果沒有意外的話,我們的分子生物學教材可能又要修改了。

科學家對生理條件下人體的DNA結構又有了新的發(fā)現(xiàn)。之前認為不可能存在于人體內(nèi)的、違反常識的DNA二級結構,澳大利亞Garvan醫(yī)學研究所的研究人員在人體內(nèi)看到了。這項研究成果刊登在了近期的《自然化學》上。

1953年,在歷經(jīng)多年的努力之后,沃森和克里克提出DNA右手雙螺旋結構模型,解開生命之秘,開啟了分子生物學時代。他們之所以能提出雙螺旋結構,是因為他們發(fā)現(xiàn),在自然界中腺嘌呤(A)是與胸腺嘧啶(T)配對的,鳥嘌呤(G)是與胞嘧啶(C)配對的。正是這種穩(wěn)定可靠的堿基互補配對原則,讓雙螺旋結構有了根基。

不過,就在沃森和克里克領走諾獎沒多久,一些科學家在實驗室發(fā)現(xiàn)了不尋常的現(xiàn)象:在那些富含GC的DNA區(qū)域,本該互補配對的G和C,在特定的實驗條件下牽起了同類的“手”,變成了G和G配對,C和C配對。

這種違反堿基互補配對原則的配對方式,讓DNA有了非比尋常的的結構。DNA單鏈上的G和G配對,就形成了G-四鏈體(G-quadruplex);C與C配對,則構成了i-motif。

稍有分子生物學基礎的人,不難想到:根據(jù)DNA雙螺旋結構的堿基互補配對原則,如果一條鏈能形成G-四鏈體,那么只要條件合適,它對面的那條鏈理論上就可以形成i-motif。

不過一直以來科學家都是在細胞外且特定的實驗條件下才能發(fā)現(xiàn)它們。例如,形成穩(wěn)定的G-四鏈體需要環(huán)境中有充足的鋰離子、鈉離子或者鉀離子[7];而i-motif的形成需要一個偏酸性的環(huán)境;而且神奇的是,它能隨著環(huán)境酸堿度的變化,快速形成和展開。

那么,它們這種隨周遭環(huán)境變化的能力有什么用?人體會形成這種結構嗎?如果有,對人體有啥影響?

如果你拿著G-四鏈體和i-motif的DNA序列,與人基因組對比一遍,就不難發(fā)現(xiàn),在人體基因組內(nèi)至少有30萬個DNA片段可以形成G-四鏈體和i-motif序列]。

其中,40%基因的調(diào)控區(qū)含有能形成G-四鏈體和i-motif的DNA序列,巧的是,癌基因的啟動子區(qū)域尤甚??茖W家已經(jīng)證實,在特定的條件下Rb、RET、VEGF、c-Myc和bcl-2等癌基因的啟動子區(qū)域可以形成G-四鏈體和i-motif。

以癌基因bcl-2為例。有研究認為,如果bcl-2基因的啟動子里形成了G-四鏈體和i-motif,會阻斷抑制bcl-2基因表達的蛋白與bcl-2基因啟動子結合,這就促進了癌基因bcl-2的表達,導致癌癥的形成或進展[17,18]。

此外,端粒DNA也有形成G-四鏈體和i-motif的能力[19]。

不過一直以來,科學家缺少可以直接在細胞內(nèi)檢測G-四鏈體和i-motif結構的手段。因此,雖然他們知道G-四鏈體和i-motif長啥樣,也知道人體有形成二者的DNA序列,就是沒辦法證實人體內(nèi)確實存在。

畢竟在生理條件下,堿基配對是要遵循堿基互補配對原則的。達不到特定的條件,是不能形成G-四鏈體和i-motif的。

本次,澳大利亞Garvan醫(yī)學研究所的MarcelE.Dinger和DanielChrist團隊找到了一個可以特異性結合i-motif的熒光抗體。有了這個抗體,研究人員就可以將細胞里的i-motif盡收眼底。

有了這樣神器,研究人員發(fā)現(xiàn),i-motif結構基本都分布在人體的細胞核里,無論是健康細胞還是細胞。通過分析一個與端粒長度有關基因的i-motif結構,研究人員在細胞內(nèi)證實,i-motif結構缺失存在于基因表達的調(diào)節(jié)區(qū)域。

此外,他們還發(fā)現(xiàn)i-motifs大多形成于細胞“生命周期”的第一階段G1期,此時細胞代謝旺盛,開始合成細胞生長需要的各種蛋白質(zhì)等物質(zhì)。于此同時,他們發(fā)現(xiàn)在此期間,i-motif結構會不停的出現(xiàn)、消失。因此,研究人員認為,i-motif的極有可能通過形成和展開,控制基因的開和關。

在文章的前面已經(jīng)介紹過,i-motif的形成和展開與周圍環(huán)境的酸堿度變化有關。Dinger和Christ團隊也在人體細胞內(nèi)證實了這個現(xiàn)象。

之前的研究表明,細胞內(nèi)的酸堿度變化與培養(yǎng)液的二氧化碳含量是負相關的,即培養(yǎng)基的二氧化碳含量越高,細胞內(nèi)的pH越低,酸性越強。于是,研究人員希望通過改變二氧化碳濃度,研究i-motif的形成與展開。

研究人員將特定細胞株系放置在培養(yǎng)液二氧化碳濃度分別為2%(pH=7.98±0.1)、5%(pH=7.51±0.07)和8%(pH=7.28±0.08)的環(huán)境中培養(yǎng)。一段時間后觀察細胞核內(nèi)的熒光位點數(shù)量,就可以知道環(huán)境酸堿度對i-motif形成的影響。

毫無意外,研究人員發(fā)現(xiàn),與二氧化碳濃度為5%的培養(yǎng)液相比,二氧化碳濃度為2%的培養(yǎng)液培養(yǎng)出來的細胞,含i-motif的DNA位點少了20%左右;二氧化碳濃度為8%的培養(yǎng)液培養(yǎng)出來的細胞,含i-motif的DNA位點多了30%左右。

這意味著,細胞周圍環(huán)境的酸堿度越低,i-motif結構越多。之前有研究表明,癌細胞內(nèi)的pH值在7.2左右,癌細胞外的pH值在6.7-7.1之間[20]。所以,理論上癌細胞的DNA里面有很多的i-motif結構。癌細胞內(nèi)外的這種酸堿環(huán)境,對i-motif結構有影響嗎?會進一步影響癌癥的發(fā)展嗎?還需要更深入的研究證實。

總的來說,澳大利亞Garvan醫(yī)學研究所的研究團隊篩選到了一個特異性極強的抗體,首次在人體內(nèi)看到了能夠快速響應酸堿度變化的i-motif結構,也初步證明它分布于很多癌基因,以及端粒的調(diào)控區(qū)。暗示i-motif結構與癌癥和衰老有一定的聯(lián)系,而且這個聯(lián)系可能與細胞周圍的酸堿性動態(tài)變化有關。實際上,G-四鏈體已經(jīng)在2013年就被劍橋大學證實在人體內(nèi)存在[21],目前科學家正在針對性的開展抗癌藥物研發(fā)工作。

毋庸置疑,這個研究讓我們對生命有了新的認知,也為疾病等的研究打開了一個新的方向。不過,這種結構對人體影響究竟如何,還需要更多的研究去探索。好在Dinger和Christ團隊已經(jīng)給我們提供了一個還不錯的工具。

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