小腸中有少數(shù)蛔蟲感染時可無癥狀，稱蛔蟲感染者，大量感染而引起疾病稱蛔蟲病。
腸道蛔蟲常引起反復發(fā)作的上腹部或臍周腹痛。由于蟲體的機械性刺激及其分泌的毒物和代謝產(chǎn)物可引起消化道功能紊亂和異性蛋白反應，如納差、惡心、嘔吐、腹瀉和蕁麻疹。兒童嚴重感染者，可引起營養(yǎng)不良，精神不安，失眠、磨牙、夜驚等。
腸內(nèi)蛔蟲一般處于安靜狀態(tài)，但受到各種刺激（如高熱、消化不良、驅(qū)蟲不當?shù)龋┖笠资够紫x騷動及鉆孔，可引起嚴重的并發(fā)癥，常見的有：
一、膽道蛔蟲癥　系蛔蟲鉆入膽道而引起，表現(xiàn)為劍突下突然發(fā)生陣發(fā)性絞痛或鉆頂痛，可放射至背部及右肩部，難于忍受，極度不安。常伴有惡心及嘔吐。腹壁軟僅疼痛發(fā)作時腹壁輕度痙攣，劍突下明顯的局限性壓痛。當進入膽道的蛔蟲退到小腸后，則癥狀突然消失。若蛔蟲進入膽囊管或肝內(nèi)膽管時，可繼發(fā)細菌感染而引起急性化膿性膽囊炎、膽管炎或急性出血壞死型胰腺炎；深入肝內(nèi)膽小管時可產(chǎn)生細菌性肝膿腫。當蛔蟲殘體或蛔蟲卵長期存留膽管或膽囊時，可以其為核心，逐漸形成膽石。
二、蛔蟲性腸梗阻　多見于小兒。由于蟲數(shù)較多，扭結(jié)成團阻塞腸腔，引起部分腸梗阻。病人有陣發(fā)性腹痛、惡心、嘔吐、腹壁軟，可捫及大小不等粗麻繩樣索狀塊物。如不及時治療，可發(fā)展為完全性腸梗阻。
三、其它 傷寒或少數(shù)胃、十二指腸潰瘍病患者感染蛔蟲后，蛔蟲可穿破病變處腸胃壁引起穿孔，產(chǎn)生彌漫性腹膜炎?；紫x向上逆行時可由鼻孔、口腔排出，或鉆入耳咽管而引起耳鼓膜穿孔，并由外耳道排蟲。偶而蛔蟲可到達喉或氣管，引起窒息。

應與其他寄生蟲引起的腸道疾病相鑒別如：阿米巴腸炎，藍氏賈第鞭毛蟲。