先天性腸閉鎖或腸狹窄的臨床表現(xiàn)主要是腸梗阻的癥狀，而癥狀出現(xiàn)
的早晚和輕重則取決于梗阻的部位和程度。腸閉鎖是完全性腸道阻塞，其主要癥狀為嘔吐、腹脹和便秘。嘔吐多于第1次喂奶后或生后第1天出現(xiàn)。出現(xiàn)的早晚與閉鎖的部位有關(guān)，十二指腸和高位腸閉鎖嘔吐出現(xiàn)的早，次數(shù)頻繁，而回腸、結(jié)腸等低位閉鎖則可于生后2～3天出現(xiàn)。嘔吐出現(xiàn)后呈進(jìn)行性加重，吐出量較多。高位腸閉鎖的病例嘔吐物為奶塊，多含膽汁，有時(shí)為陳舊性血性，奶后嘔吐加重。少數(shù)十二指腸發(fā)生在膽總管開口以上，則嘔吐物中無膽汁。低位閉鎖嘔吐物可呈糞便樣并帶臭味。
腹脹是腸閉鎖的常見體征，腹部膨脹的程度與閉鎖的位置和就診時(shí)間有關(guān)。一般閉鎖的位置越高就診時(shí)間越早，腹脹程度就越輕，反之則越重。高位閉鎖的病例，腹脹僅限于上腹部，多不嚴(yán)重，在大量嘔吐之后或置胃管抽出胃內(nèi)容后，腹脹可消失或明顯減輕。低位閉鎖的病例，全腹呈一致性膨脹，進(jìn)行性加重。大量嘔吐或抽出胃內(nèi)容后，腹脹仍無明顯改變。高位腸閉鎖時(shí)偶爾在上腹部可見胃型或胃蠕動(dòng)波，低位腸閉鎖時(shí)往往可見到擴(kuò)張的腸袢。
新生兒出生后無正常胎便排出是腸閉鎖的重要表現(xiàn)。正常新生兒多于生后24h內(nèi)排出正常胎糞，呈墨綠色。其中除有胃、腸、肝、胰等的分泌液和腸黏膜的脫落細(xì)胞外，尚有胎兒吞咽的羊水和自己的皮膚角化細(xì)胞。腸閉鎖的病兒，出生后多無胎糞排出。有的僅排出少量灰白色或青灰色黏液樣物，為閉鎖遠(yuǎn)段腸管的分泌物和脫落的細(xì)胞。與正常胎糞不同。有人報(bào)道個(gè)別病兒也可能有少量胎糞排出。
在生后最初幾小時(shí)，病兒全身情況良好與正常兒無區(qū)別。但很快則表現(xiàn)為躁動(dòng)不安，不能入睡，不吃奶或吸吮無力。由于嘔吐頻繁，很快出現(xiàn)脫水及中毒狀，且往往伴有吸入性肺炎，全身情況迅速惡化。如同時(shí)有腸穿孔腹膜炎，可因發(fā)生氣腹，使腹脹更加明顯，腹壁水腫、發(fā)紅發(fā)亮、腹壁靜脈怒張，腸鳴音消失;并出現(xiàn)呼吸困難、發(fā)紺、體溫不升及全身中毒癥狀。
腸狹窄的臨床癥狀則視狹窄的程度而有所不同。少數(shù)有顯著狹窄的病例，出生后即有完全性腸梗阻的表現(xiàn)，與腸閉鎖很難區(qū)別。多數(shù)在出生后有不完全性腸梗阻，臨床表現(xiàn)為反復(fù)多次嘔吐，嘔吐物為奶塊及膽汁。出生后有胎糞排出，但其量較正常少。腹脹程度視狹窄部位而定：高位狹窄腹脹限于上腹部;低部狹窄則全腹膨脹。因?yàn)槭锹圆煌耆阅c梗阻，在腹部往往可見腸型和腸蠕動(dòng)波，同時(shí)有腸鳴音亢進(jìn)。
小腸閉鎖有15.8%～45%伴有羊水過多，尤以空腸閉鎖多見，羊水量可超過2000～2500ml。母親有羊水過多者，嬰兒出生后即出現(xiàn)持續(xù)性嘔吐，進(jìn)行性腹脹以及無正常胎糞排出，即應(yīng)懷疑腸閉鎖的可能。如做肛門指診或用0.9%生理鹽水灌腸仍無正常胎糞排出，則可除外由于胎糞黏稠所引起的胎糞性便秘和先天性巨結(jié)腸。上述情況非常重要。

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