1.腸道并發(fā)癥
(1)急性暴發(fā)型潰瘍結腸炎：可出現(xiàn)急性結腸擴張和潰瘍穿孔;下消化道出血;結腸假性息肉，呈多發(fā)、大小不等，有時呈鵝卵石樣;結腸狹窄多見于直腸和橫結腸，也可見于其他部位。
(2)中毒性巨結腸(toxic megacolon)：是一種嚴重的并發(fā)癥，發(fā)生率1.6%～2.5%，病死率13%～50%。多見于急性暴發(fā)型和重型患者。誘因多與服用過多抗膽堿藥物、低鉀、鋇劑灌腸有關。結腸病變廣泛嚴重，累及腸道肌層及肌間神經(jīng)叢，使腸管擴張不能收縮，腸腔直徑可達10cm以上。中毒癥狀明顯，出現(xiàn)腹脹，腹部壓痛、反跳痛，腸鳴音減弱或消失，白細胞明顯升高，X射線平片可見結腸擴大，結腸袋形消失。由于腸道擴張，可發(fā)生缺血、壞死，造成急性腸穿孔(acute intestinal perforation)。
(3)結腸穿孔(intestinal perforation)：及直腸大出血：發(fā)生率在1%左右，病死率在40%～50%。原因為：①中毒性巨結腸擴張的基礎上發(fā)生;②慢性期狹窄者發(fā)生;③高壓鋇劑灌腸誘發(fā)。
(4)息肉(polyp)：為晚期并發(fā)癥，發(fā)生率9.7%～39%，由炎癥所致。一般為結腸假性息肉(pseudo-polyp)。
(5)癌變(canceration)：晚期可發(fā)生癌變，發(fā)生率5%～10%。病變主要發(fā)生在重型患者、病變累及全結腸和病程漫長的患者。癌變在兒童病例中較少。病程越長癌變傾向越高，發(fā)病后第1個10年癌變率約為3%，以后每年遞增0.5%～1.0%，第2個10年可達10%～20%，故患兒應1年行一次結腸鏡檢查。晚期并發(fā)癥尚有肛周感染、肛瘺等。
2.腸道外并發(fā)癥
(1)關節(jié)受累：潰瘍性結腸炎中關節(jié)受累約25%，表現(xiàn)為非致畸形性游走性急性關節(jié)炎，如腫脹、疼痛;同時受累可以是1個或多個關節(jié)，各個關節(jié)均可侵犯，但以膝、踝和腕關節(jié)多見。
(2)皮膚損害：較常見，嚴重的活動性潰瘍性結腸炎約15%有皮膚損害，結節(jié)性紅斑較常見，且愈后不留瘢痕;壞疽性膿皮病為潰瘍性損害，常見于軀干部，愈后留有瘢痕。在疾病的活動期，其發(fā)生率為5%～10%，但可治愈。
(3)眼部：鞏膜外層炎、復發(fā)性虹膜炎及葡萄膜炎的發(fā)生率約為5%。
(4)大出血(massive hemorrhage)：發(fā)生率為1.1%～4.0%。發(fā)生原因是潰瘍累及大的血管發(fā)生出血，及低凝血酶原血癥(hypoprothrombinemia)。
(5)其他：晚期可并發(fā)脂肪肝、硬化性膽管炎、慢性肝炎;亦易發(fā)生貧血、營養(yǎng)不良、腎結石。